Theo mình, ngay tại thời điểm phát hiện ra sai sót (04/04/2013) : bạn làm và nộp lại tờ khai Thuế GTGT Tháng 9 trong đó bỏ HĐ66 => giàm số tiền thuế, và khai lại báo cáo sử dụng hóa đơn Q3 kê thêm hóa đơn HĐ66 vào mục hóa đơn xóa bỏ
Với báo cáo quý 4: bạn không cần làm lại báo cáo sử dụng hóa đơn (nếu bạn đã khai sử dụng HĐ75), mà làm lại tờ khai GTGT tháng 11: có HĐ75 với số tiền bằng với HĐ66 (phần ghi chú bạn ghi là xuất thay hóa đơn 66) => tăng số tiền thuế.
Nếu có hóa đơn khác nào sót bạn cứ làm như trên.
Cuối năm hay khi nào cơ quan thuế gởi bảng đối chiếu chi tiết thuế: bạn dò lại xem khớp với khai báo của mình không.
Nếu số liệu khớp với CQ thuế : OK
Nếu số liệu không khớp: bạn làm công văn xin điều chỉnh gởi CQ thuế quản lý trực tiếp để họ điều chỉnh theo số liệu mình đã khai lại.
Cty mình đã bị trường hợp tương tự như vậy, nhưng không thấy/chưa thấy CQ thuế thông báo hay ra ra quyết định phạt, chỉ phải tốn tiền "bồi dưỡng" để các ACE phấn khởi làm việc nhanh chóng và rốt ráo thôi.