Đơn vị tôi là bên B, căn cứ vào khối lượng thẩm tra đợt 1, Bên A tạm ứng cho đơn vị tôi 60 triệu, đơn vị tôi đã xuất hóa đơn giá trị gia tăng 60 triệu vào năm 2011. Đến năm 2012 Sau khi thẩm tra lại kết quả công việc thanh lý hợp đồng đã thực hiện thì giá trị công việc đã làm chỉ đạt được 20 triệu, đơn vị tôi phải hoàn lại cho bên A 40 triệu. Các bạn cho tôi hỏi. Bây giờ đơn vị tôi phải trả cho bên A 40 triệu vậy số tiền thuế GTGT đơn vị tôi đã nộp cho ngân sách thì bây giờ làm thế nào? có được hoàn lại không? Thủ tục gồm những gì với cơ quan thuế để được hoàn lại ? Rất mong sự giúp đỡ của các bạn. Xin chân thành cảm ơn.