1/ Căn cứ Thông tư số 16/1999/TT-BTC ngày 04.02.1999 của Bộ Tài chính hướng dẫn thực hiện thuế cước ;
- Tiền cước vận chuyển làm căn cứ tính thuế cước không bao gồm tiền cước đã tính thuế cước tại cảng Việt Nam đối với chủ tàu nước ngoài và tiền cước trả cho doanh nghiệp vận tải Việt Nam do đã tham gia vận chuyển hàng từ cảng Việt Nam đến một cảng trung gian. Trường hợp Công ty kê khai, nộp thay thuế cước cho hãng tàu nước ngoài A mà hãng tàu A (hoặc Công ty) thuê hãng tàu nước ngoài B chuyên chở hàng hóa từ Việt Nam đến cảng trung gian và hãng tàu B đã nộp đủ phần thuế cước của họ thì doanh thu tính thuế cước của hãng tàu A được loại trừ khoản tiền cước đã trả cho hãng tàu B. Như vậy Công ty cần xuất trình chứng từ đã nộp thuế cước của hãng tàu B.
- Lưu ý : Doanh thu tính thuế cước đối với hàng xuất không phân biệt thu tại Việt Nam hay thu tại nước ngoài. Nếu Công ty chỉ kê khai căn cứ tổng số tiền cước thu hộ tại Việt Nam là không đầy đủ.
- Trường hợp Công ty kê khai, nộp thay thuế cước không đúng, đủ theo quy định thì Công ty phải kê khai, nộp bổ sung sau đó cấp biên lai bổ sung cho từng chuyến tàu. Công ty sẽ bị xử lý theo quy định tại phần V Thông tư số 16/1999/TT-BTC.
2/ Các khoản phí chi hộ hãng tàu nước ngoài, Công ty không hạch toán vào chi phí của Công ty. Đây là chi phí của hãng tàu nước ngoài nên khi họ yêu cầu Công ty có thể chuyển chứng từ gốc cho hãng tàu. Lưu ý : trường hợp Công ty thu hộ các khoản phí cho hãng tàu thì Công ty không hạch toán vào doanh thu của Công ty nhưng phải kê khai, nộp thay thuế Nhà thầu theo các Thông tư 169/1998/TT-BTC ngày 22.12.1998, số 95/1999/TT-BTC ngày 06.08.1999 và số 05/2005/TT-BTC ngày 11.01.2005 của Bộ Tài chính
- Tiền cước vận chuyển làm căn cứ tính thuế cước không bao gồm tiền cước đã tính thuế cước tại cảng Việt Nam đối với chủ tàu nước ngoài và tiền cước trả cho doanh nghiệp vận tải Việt Nam do đã tham gia vận chuyển hàng từ cảng Việt Nam đến một cảng trung gian. Trường hợp Công ty kê khai, nộp thay thuế cước cho hãng tàu nước ngoài A mà hãng tàu A (hoặc Công ty) thuê hãng tàu nước ngoài B chuyên chở hàng hóa từ Việt Nam đến cảng trung gian và hãng tàu B đã nộp đủ phần thuế cước của họ thì doanh thu tính thuế cước của hãng tàu A được loại trừ khoản tiền cước đã trả cho hãng tàu B. Như vậy Công ty cần xuất trình chứng từ đã nộp thuế cước của hãng tàu B.
- Lưu ý : Doanh thu tính thuế cước đối với hàng xuất không phân biệt thu tại Việt Nam hay thu tại nước ngoài. Nếu Công ty chỉ kê khai căn cứ tổng số tiền cước thu hộ tại Việt Nam là không đầy đủ.
- Trường hợp Công ty kê khai, nộp thay thuế cước không đúng, đủ theo quy định thì Công ty phải kê khai, nộp bổ sung sau đó cấp biên lai bổ sung cho từng chuyến tàu. Công ty sẽ bị xử lý theo quy định tại phần V Thông tư số 16/1999/TT-BTC.
2/ Các khoản phí chi hộ hãng tàu nước ngoài, Công ty không hạch toán vào chi phí của Công ty. Đây là chi phí của hãng tàu nước ngoài nên khi họ yêu cầu Công ty có thể chuyển chứng từ gốc cho hãng tàu. Lưu ý : trường hợp Công ty thu hộ các khoản phí cho hãng tàu thì Công ty không hạch toán vào doanh thu của Công ty nhưng phải kê khai, nộp thay thuế Nhà thầu theo các Thông tư 169/1998/TT-BTC ngày 22.12.1998, số 95/1999/TT-BTC ngày 06.08.1999 và số 05/2005/TT-BTC ngày 11.01.2005 của Bộ Tài chính