Căn cứ tính thuế tài nguyên là sản lượng tài nguyên thương phẩm khai thác trong kỳ, đơn giá tính thuế tài nguyên và thuế suất thuế tài nguyên.
Số thuế tài nguyên phải nộp trong kỳ nộp thuế được tính như sau:
Thuế tài nguyên phải nộp trong kỳ = Sản lượng tài nguyên thương phẩm khai thác trong kỳ x Giá tính thuế đơn vị tài nguyên x Thuế suất - Số thuế tài nguyên được miễn, giảm (nếu có)
Trường hợp tài nguyên được cơ quan nhà nước ấn định mức thuế tài nguyên phải nộp trên một đơn vị tài nguyên khai thác thì số thuế tài nguyên phải nộp được xác định như sau:
Thuế TN phải nộp trong kỳ = sản lượng TN thương phẩm khai thác trong kỳ x Mức thuế TN ấn định trên một đơn vị TN