Trong 6 tháng đầu năm công ty mình kê tờ khai thuế GTGT nhưng vì là công ty phần mềm nên đã không kết chuyển phần thuế khấu trừ. Vậy công ty mình làm tờ khai thuế bổ xung cho thuế cho 6 tháng trước để xin khấu trừ được không? Vì công ty mình có mảng dịch vụ nên đầu ra có thuế suất là 10%, mà với những HD về bán phần mềm thì thuế suất bằng 0%. Khi làm tờ khai thuế bổ xung thì có bị phạt vì nộp tờ khai bổ xung muộn không?