Ngày 22/2/2006, Tổng cục Hải quan có công văn số 679/KTTT gửi hải quan các tỉnh, thành phố hướng dẫn thực hiện thống nhất như sau:
Đối với trường hợp trong bộ hồ sơ đề nghị hoàn thuế (không thu thuế), doanh nghiệp không xuất trình được chứng từ thanh toán có tên người thanh toán phù hợp với tên người phải thanh toán như đã thoả thuận trong hợp đồng hoặc phụ lục hợp đồng thì việc thanh toán qua bên thứ ba này phải được thể hiện rõ trong hợp đồng hoặc phụ lục hợp đồng mua bán. Nếu hợp đồng hoặc phụ lục hợp đồng mua bán không thể hiện việc thanh toán qua bên thứ ba, doanh nghiệp phải xuất trình thông báo bằng văn bản của phía người mua về việc bên thứ ba sẽ thanh toán hộ cho lô hàng đó. Đồng thời, doanh nghiệp phải có cam kết bằng văn bản về việc khai báo thì chấp nhận chứng từ thanh toán đã xuất trình để làm thủ tục hoàn thuế (không thu thuế) đối với nguyên liệu nhập khẩu đã đưa vào sản xuất hàng xuất khẩu./.
Đối với trường hợp trong bộ hồ sơ đề nghị hoàn thuế (không thu thuế), doanh nghiệp không xuất trình được chứng từ thanh toán có tên người thanh toán phù hợp với tên người phải thanh toán như đã thoả thuận trong hợp đồng hoặc phụ lục hợp đồng thì việc thanh toán qua bên thứ ba này phải được thể hiện rõ trong hợp đồng hoặc phụ lục hợp đồng mua bán. Nếu hợp đồng hoặc phụ lục hợp đồng mua bán không thể hiện việc thanh toán qua bên thứ ba, doanh nghiệp phải xuất trình thông báo bằng văn bản của phía người mua về việc bên thứ ba sẽ thanh toán hộ cho lô hàng đó. Đồng thời, doanh nghiệp phải có cam kết bằng văn bản về việc khai báo thì chấp nhận chứng từ thanh toán đã xuất trình để làm thủ tục hoàn thuế (không thu thuế) đối với nguyên liệu nhập khẩu đã đưa vào sản xuất hàng xuất khẩu./.
